O COBEM, que é um dos mais tradicionais e respeitados congressos da área, aborda diversos temas importantes por meio de seus eixos temáticos, como currículo e formação, métodos de ensino, avaliação, educação e saúde e prática profissional. Estes temas foram escolhidos para promover o debate aprofundado sobre a modernização e eficácia do ensino médico com vista à formação de futuros médicos e à melhoria da qualidade dos cuidados de saúde no país.