Mulheres e crianças estavam entre os passageiros quando a balsa virou no distrito de Shendi, no norte da província do Rio Nilo, na quarta-feira.
A Rede de Médicos do Sudão disse que pelo menos 15 corpos foram recuperados.
Moradores e equipes de resgate ainda procuram pelo menos seis pessoas. O grupo disse que seis pessoas sobreviveram à tragédia.
A rede apelou às autoridades para mobilizarem equipas e equipamentos de resgate especiais para acelerar os esforços de busca.
Tais tragédias em barcos sobrecarregados não são incomuns nas vias navegáveis do país africano, onde as medidas de segurança são frequentemente ignoradas.